Sovietinės okupacijos metais, siekdama išsaugoti Lietuvos atmintį, Kanados lietuvių bendruomenė aktyviai siekė įkurti muziejų lietuvių veiklos, gyvenimo, istorijos ir kultūros kolekcijoms saugoti. Praėjusio šimtmečio devintajame dešimtmetyje Kanados lietuvių bendruomenės vadovybė nutarė šią instituciją steigti.
Kanados lietuvių bendruomenės tarybos suvažiavime 1983 m. buvo pritarta V. Matulaičio pasiūlymui steigti Kanados lietuvių archyvą, o nuo 1984 m. idėja energingai plėtota. 1985 m., nutarus išplėsti lietuvių kultūros centrą „Anapilis”, vadovybė pasiūlė archyvui skirti reikiamas erdves.
Nors Kanados lietuvių muziejus-archyvas visuomenei duris atvėrė 1989 m. rugsėjo 24 d., pirmosios kolekcijos ir dokumentai pradėti rinkti jau 1988 m. Pirmoji gauta kolekcija priklausė Elzei Jankutei – Mažosios Lietuvos patriarcho Martyno Jankaus dukrai.
Nuo įkūrimo prie archyvo veiklos nuolat prisideda Kanados lietuvių bendruomenės savanoriai. Jų nenuilstančio darbo dėka archyvui pavyko išlaikyti aukštus muziejininkystės standartus ir išsaugoti Kanados lietuvių paveldą.
Muziejuje keturis ar penkis kartus per metus rengiamos naujos parodos, švenčiamos Lietuvos kankinių parapijos bei kitos šventės. Per savo gyvavimo laikotarpį muziejus parodas yra pristatęs Toronto universitete, įvairiuose muziejuose ir parapijose.
Parengta pagal LR ambasados Kanadoje informaciją